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江苏省无锡市环境监测中心站片状微囊藻基因组科研项目日前完成。目前片状微囊藻已经顺利进入中科院淡水藻种库,极大地提升了无锡市环境监测中心站的生物监测能力,以及中心站在生物监测领域内和蓝藻水华领域内的研究地位。
据了解,中心站这一项目的完成填补了国内片状微囊藻研究领域内的空白,更新了国内微囊藻属的系统分类。微囊藻Microcystis作为太湖蓝藻水华的主要种类,探索其形态分类和生理特征对蓝藻水华监测和蓝藻水华的暴发机制研究均有重大意义。
据了解,2010年以来,无锡市环境监测中心站对太湖微囊藻水华进行了深入的系统分类学研究。片状微囊藻(Microcystispanniformis)于2011年8月首次在太湖发现,经鉴定为微囊藻属Microcystis在中国的一个新纪录种。
随后,项目组在藻株纯培养和DNA提取上克服困难,最终完成这一科研课题。
片状微囊藻基因组完成图的获得,其藻株纯培养是关键,因为杂菌会严重影响到基因组最后的拼接。
2013年12月,课题组共培养了3批次的片状微囊藻,但是均因杂菌过多,未能进行下一步实验。最后课题组修改了藻株的培养方案。2014年4月,片状微囊藻纯培养实验经过多方案和反复扩大培养,课题组最终较好地克服了杂菌干扰的技术难题。随后,结合前期的广泛调研,最终在12家实力雄厚的测序公司中,确定了合适的测序委托单位。
藻类高质量DNA的提取是课题组面临的另一挑战。课题组相继尝试了多种提取方法,最终在2014年11月初获得了符合建库条件的DNA。
2015年1月开始,课题组进一步整合东南大学和中科院水生所的科研资源,并随后成功拼出片状微囊藻的基因组完成图,从而成为国内第一个、国际上第二个获得Microcystis基因组完成图的单位。
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